Puerto Rico também possui seus próprios programas de seguro de saúde público que cobrem residentes elegíveis. Programas financiados pelo governo, como o Plano de Saúde do Governo (Mi Salud), oferecem cobertura de seguro de saúde para indivíduos e famílias de baixa renda que atendem aos critérios de renda e elegibilidade.
Além disso, o programa Medicaid (Medicaid de Porto Rico) oferece cobertura de assistência médica para certos indivíduos de baixa renda, mulheres grávidas, crianças e pessoas com deficiência.
Além de tudo, Porto Rico faz parte do programa Medicare dos Estados Unidos, que oferece cobertura de assistência médica para idosos e pessoas com deficiência. Os beneficiários do Medicare em Porto Rico podem acessar os mesmos benefícios e serviços disponíveis nos Estados Unidos.